الکتروفورز یک روش رایج در جداسازی بیومولکولها بر اساس بار الکتریکی و وزن مولکولی است. برای جداسازی مولکولهای پروتئینی و اسیدهای نوکلئیک می توان از روش SDS-PAGE استفاده کرد. در این روش SDS سبب پوشش حداکثری مولکولها با بار منفی می گردد. فلذا اساس جداسازی در این روش بر مبنای وزن مولکولی خواهد بود. در این روش مولکولهای اکریل آمید در یک فرایند شیمیائی به یکدیگر متصل شده و ماتریکس ژلی پلی اکریل آمید تشکیل می شود. درصد وزنی مولکولهای اکریل آمید تعیین کننده میزان خلل و فرج ژل می باشد که هر چه بیشتر باشد امکان عبور به مولکولهای کوچکتر را خواهد داد. در SDS-PAGE پروتئینها، معمولا از ژل 12 درصد برای قدم اول استفاده می شود. اما ممکن است بر حسب وزن مولکولی مورد نظر نیاز به درصدهای دیگر ژل باشد.