رنگ آمیزی ژل SDS-PAGE یکی از روشهای رایج در آزمایشگاههای پروتئومیکس برای قابل مشاهده کردن پروتئین جداشده در فرایند الکتروفورز است. برای این منظور روشهای مختلفی برای رنگ آمیزی پروتئین به کار گرفته می شود. روش کوماسی بلو از جمله روشهای رایج و ارزان در این خصوص است. منتهی استفاده از رنگ کوماسی بلو معمولی می تواند سبب ایجاد رنگ زمینه زیاد شود که با رنگبری نیز مقداری از رنگ باقی مانده و سبب جلوگیری از وضوح در پروتئینهای رنگ شده می گردد. برای افزایش وضوح در مشاهده پروتئینهای رنگ آمیزی شده، استفاده از کیت رنگ آمیزی کوماسی با پس زمینه روشن توصیه می گردد. همچنین استفاده از این کیت برای مشاهده پروتئینهایی که با مقدار کم در سلول بیان می شوند انتخاب خوبی است.